Цель. Цель предлагаемого исследования заключается в развитии представлений о внутриагломерационной дифференциации, а также в разработке практических рекомендаций по оценке дифференциации в уровне социально-экономического развития (СЭР) поселений агломерации. Методы. В качестве методов проведения оценки дифференциации в уровне СЭР поселений агломерации предложено использовать методы статистического и математического анализа, разработанные для изучения социально-экономической дифференциации между территориальными социально-экономическими системами. Результаты. Выявлено, что изучение различных аспектов дифференциации в уровне СЭР территорий (в т. ч. и агломераций поселений) в современных условиях является весьма актуальным научным направлением и выступает объектом устойчивого интереса российских исследователей. Определено, что дифференциация поселений по уровню СЭР представляет собой несогласованную динамику и неоднородность среднедушевых значений социально-экономических показателей поселений агломерации, обусловленные совокупностью факторов различной природы, а именно: экономических, социальных, инфраструктурных, исторических и культурных, административно-политических, географических, природно-климатических, институциональных. Сделан вывод, что несмотря на наблюдающуюся тенденцию сглаживания между поселениями Томской агломерации разрывов в динамике показателей (введенных в действие жилых домов, оборота розничной торговли и инвестиций в основной капитал), по абсолютным значениям данных показателей, рассчитанных на душу населения, в 2015 г. наблюдается рост масштабов внутриагломерационной дифференциации. Тем не менее, следует отметить, что различные показатели СЭР могут показывать различные тенденции, поэтому при углубленном анализе целесообразно использовать тщательно отобранную систему показателей. Научная новизна. Научно-теоретическая новизна исследования заключается в систематизации и развитии теоретических положений исследования внутриагломерационной дифференциации. Научно-практическая новизна исследования состоит в оценке дифференциации в уровне СЭР поселений Томской агломерации.