Цель: изучение причинно-следственных связей и мотивов выбора регулятором в сфере сельского хозяйства (Министерством сельского хозяйства) тех, или иных целевых показателей результативности реализации подпрограммы поддержки малого и среднего предпринимательства, являющейся частью системы мер содействия достижению целевых параметров региональных программ. Методы: монографический; диалектика; теоретические методы-операции: системного анализа и синтеза; индукции и дедукции; обобщение; абстрагирование; конкретизация; моделирование; мысленный эксперимент; графический. Результаты и практическая значимость: при сравнении двух главных подпрограмм - Федеральной финансовой программы поддержки малого и среднего предпринимательства и «Развитие отраслей агропромышленного комплекса», выявлены направления развития системы целевых индикаторов Государственной программы развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия на 2013 - 2020 годы, касающихся сферы малого и среднего бизнеса, определен вектор ее реализации, связанный с кооперацией. Рекомендации могут быть использованы в процессе коррекции направлений мониторинга и оценки деятельности субъектов малого и среднего бизнеса. Научная новизна: предложение расширять систему индикаторов эффективности реализации Государственной программы развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия на 2013 - 2020 годы в ключе происходящих изменений в системе финансовой инфраструктуры поддержки, опираясь на гарантийные операции, детализацию кредитных операций в части освещения результативности работы бизнеса в пределах госзаказа, участия МСП Банка; индиаторы деятельности сельскохозяйственных потребительских кооперативов. В целом, доказана необходимость реализации программ поддержки в соответствии со спецификой концепции развития малого и среднего бизнеса, в отличие от крупного, вне «единой субсидии».