Цель. Научное обоснование методических подходов, направленных на решение проблемы обеспеченности населения региона продуктами питания собственного производства и достижение региональной продовольственной безопасности. Методы. В ходе выполнения исследования использовались следующие методы: монографический, системного анализа, расчетно-конструктивный, абстрактно-логический и графический. При проектировании стратегии импортозамещения в агропродовольственном комплексе Республики Башкортостан обосновано применение методов стратегического планирования. Результаты. В статье показана значимость и роль импортозамещения в обеспечении продовольственной безопасности страны. Обосновывается необходимость разработки стратегии импортозамещения в агропродовольственном комплексе на уровне субъектов Российской Федерации. Региональный аспект импортозамещения в агропродовольственном комплексе апробируется на примере Республики Башкортостан. Предложен алгоритм проектирования стратегии развития агропродовольственного комплекса региона на зональном уровне. Представлены результаты анализа современного состояния и развития агропродовольственного комплекса Республики Башкортостан. Сделан вывод о необходимости использования системного подхода и методов стратегического планирования при разработке стратегии импортозамещения в агропродовольственном комплексе региона. Резюмируется, что ключевой компонентой стратегии импортозамещения должна стать ориентация на получение синергетического эффекта от использования природно-ресурсного и производственного потенциала аграрной сферы региона. Научная новизна. Научная новизна исследования заключается в методическом обосновании и разработке алгоритма проектирования стратегии развития агропродовольственного комплекса региона на зональном уровне при реализации политики ускоренного импортозамещения в условиях экономических санкций и ответного продуктового эмбарго.